PDFファイルから、テーブル分のデータを取り出して、Excelへエクスポートする方法をやはり見つかりませんでした。PDFTextExtratorを使って、ページ毎でテキストを出力し、整形してから、Excel形式で作成しました。
　Bookmarkletは面白いです。足りないのは、ローカルファイルシステムをアクセスできないことですね。収集した情報を新しいタブに表示できますから、デバッグに大部助かります。
　Javascriptは基本的にどのブラウザーでも動くから、OS、ブラウザーを気にせず、交換性が高いので、Javaよりも、Write Once, Run Evevery。
　IEなら、FileSystemObjectを使えるから、Mac OSでも、強力になるでしょうか。
　明日自転車で通勤したいです。